ปัจจุบัน ศ.ดร.อาณัติ ลีมัคเดช ดำรงตำแหน่งศาสตราจารย์ภาควิชาการเงิน และผู้อำนวยการโครงการปริญญาโททางการเงิน คณะพาณิชยศาสตร์และการบัญชี มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ รวมทั้งเป็นอนุกรรมการบริหารความเสี่ยง องค์การสวนสัตว์ ในพระบรมราชูปถัมภ์